| สำนักอำนวยการ |
| กลุ่มประชาสัมพันธ์ |
| กลุ่มออกแบบและก่อสร้าง |
| สำนักนโยบายและแผน |
| กลุ่มสารสนเทศ |
| ระบบบริหารสถานศึกษา |
| ศูนย์ปฏิบัติการสพฐ |
| สนง.โครงการอาหารกลางวัน |
| สำนักติดตามและประเมินผล |
| สำนักพัฒนาระบบบริหารงานบุคคล |
| กลุ่มวิจัยพัฒนากฏหมาย ฯ |
| กลุ่มวิจัยเสริมสร้างพัฒนาวินัย |
| สำนักการคลังและสินทรัพย |
| สำนักเทคโนเพื่อการเรียนการสอน |
| สำนักพัฒนานวัตกรรมการจัดการฯ |
| สำนักบริหารงานการศึกษาพิเศษ |
| สำนักวิชาการและมาตรฐาน ฯ |
| สำนักทดสอบทางการศึกษา |
| ศูนย์ GPA |
| สถาบันทดสอบแห่งชาติ สทศ |
| สำนักพัฒนาครูและบุคลากร ฯ |
| สำนักพัฒนากิจกรรมนักเรียน |
| หน่วยตรวจสอบภายใน |
| สถาบันภาษาอังกฤษ |
| สำนักพัฒนาการศึกษาภาคใต้ ฯ |
| กลุ่มพัฒนาระบบบริหาร |
| สำนักงานรับรองมาตรฐาน |
| สำนักงานปลัดกระทรวงศึกษา |
| สำนักงานเลขาธิการสภาการศึกษา |
| สำนักงาน กคศ. |
| สำนักงานคุรุสภา |
| สำนักงาน กศน. |
| สำนักงาน สกสค. |
| สำนักงานงานการอุดมศึกษา |
| สำนักงานการอาชีวศึกษา |
| สำนักมาตรฐานอาชีวศึกษา/อาชีพ |
| ศูนย์เทคโนโลยีสารสนเทศฯ ศธ |
| ศูนย์เทคโนโลยีทางการศึกษา |
| สำนักงานการลูกเสือ ยุวกาชาด |
| โครงการโรงเรียนในฝัน (ใกล้บ้าน) |